В 1964 году на основании распоряжения Исполнительного комитета Московского совета депутатов трудящихся от 24.06.1964 № 1501 был создан "Дом для инвалидов №16" МосгорУсо. На территории находилось три 4-х этажных корпуса, рассчитанных на 610 койко-мест. 

В 1967 году интернат был перепрофилирован в психоневрологический.

С 1969 года начинается плановая реконструкция спальных корпусов, выделяются помещения для медицинских кабинетов, аптеки, лаборатории, стерилизационного блока.

В 1974 году на территории интерната по индивидуальному проекту было построено 2-­х этажное здание лечебно-трудовых мастерских  на 250 посадочных мест в одну смену.

В 1975 году по распоряжению МосгорУсо определяется профиль учреждения как молодежный. С этого времени в интернат из ДДИ направляются инвалиды, достигшие 18-летнего возраста, способные к дальнейшему обучению бытовым и трудовым навыкам.

С 1978 года в штатное расписание были введены должности  воспитателей. С этого времени началась кропотливая работа по переориентации функций персонала с надзорно-охранительных на функции коррекционного воспитания и обучения.

В 1980 году за разработку и внедрение методов реабилитации хронических психически больных в практическую деятельность психоневрологических интернатов, учреждение было награждено Дипломом 1-й степени ВДНХ.

В 1996 году Постановлением Министерства соцтруда и социального развития РФ Психоневрологический интернат № 16 объявлен опорно­-экспериментальным учреждением.